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联系我们 诺禾致源联袂河北农业大学助力当代品种大豆育种改换
发布日期：2024-10-18 06:21 点击次数：148
9月9日，诺禾致源与河北农业大学互助的大豆育种改换名堂，在Nature Genetics (IF：31.7) 期刊在线发表了题为“High-quality genome of a modern soybean cultivar and resequencing of 547 accessions provide insights into the role of structural variation”的著作。该商榷拼装了一个高质料大豆当代品种Nongdadou2基因组(NDD2)，新产生了547份来自中国9个省份和好意思国大豆教授区的种质崇高度重测序数据，并聚首29个已发表大豆基因组构建了大豆的图形泛基因组，为SV在大豆改换中的作用机制提供了新资源和新视力。
河北农业大学张彩英、邵振启、孔佑宾、杜汇、李文龙、杨占武和诺禾致源李祥孔为论文共同第一作家，河北农业大学张彩英教授、李喜焕教授、马峙英教授和诺禾致源首席科学家田仕林商榷员为论文共同通信作家。该商榷中，PacBio、Nanopore、lllumina、Hi-C、Bionano等建库测序及分析作事由诺禾致源提供。
跨度分析：上期跨度上升开出1路、偶数70，近10期跨度012路比为2：4：4，奇偶比为7：3，升降平次数比为5：5：0，本期预计偶数跨度连出，关注跨度78。
▲ 互助著作于Nature Genetics在线发表 图源：Nature官网
大豆不错提供卵白质、油脂和多种与健康关联的化合物。合并结构变异（SVs）对农艺经济性状的影响关于大豆育种改换终点清贫。该商榷拼装了大豆当代品种农大二号（NDD2）的高质料基因组，聚首29个已报谈的大豆基因组序列构建了大豆图形泛基因组，软件定做定制开发随意出47,058 SVs，其影响了25,814个功能基因。商榷随意并考据了13个NDD2私有的插入/缺失变异，并揭示其与大豆的产量和种子品性等农艺性状关联。商榷还发现了1个与干旱合乎性关联的大倒位变异，以及1个可能导致大豆先人种（野生大豆）分化的大型易位变异。临了，还通过SV-GWAS时刻在547份种质重测序数据中随意了6,013个SVs与大豆产量和种子品性等性状显耀关联，包含了1,761个调控基因功能的SVs，其中12个通过调控基因GmMQT来影响大豆的油脂和异黄酮含量。该商榷胁制为大豆育种改换中SV的作用机制提供了资源和视力。
高质料的科学商榷离不开精确的数据分析。诺禾致源凭借自主设置的生信分析软件和数据库联系我们，为海量的基因序列解读及组学数据分析提供撑抓。通过对人命大数据进行归纳整理、搭建全面超越的数据中心、提高数据分析体系和经过启动着力，诺禾致源的数据分析整合才智得到束缚进步，并在多项商榷中发达清贫作用，匡助大家学者赢得了丰硕的商榷效果。当年，诺禾致源将不时立异和完善基因测序及生物信息分析时刻和经管决议体系，助力更多商榷学者在科研谈路上稳步上前，以超越的基础科研作事助推产业高质料发展。